近年來，醫藥行業一直呼吁降低稅費，營改增、兩票制等政策施行后，藥企感受到更加直接的財稅壓力。 3 月 4日，全國人大代表、山東新華醫療器械股份有限公司董事長趙毅新在“兩會”醫藥界代表委員座談上建議，現階段企業增值稅稅率高，企業經營負擔重，面對機遇與挑戰更需要政府的鼓勵和扶持。公開資料顯示，目前缺少針對醫藥研發投入的財稅優惠政策，國家對研發投入雖有加計扣除的鼓勵政策，但在具體執行上存在挑戰，使得很多主要的研發型藥企只有不足一半的研發費用可以享受優惠，對于很多財務制度尚不健全的中小企業影響更大。 具體而言，國家規定 500 萬元以下的生物醫藥新品種的技術轉讓不征稅，但沒明確什么是“生物醫藥新品種”。地方稅務局的解讀是獲得生產批件的新藥。這并不符合目前研發技術轉讓的規律。新藥在臨床前，一期、二期、三期等都可以進行技術轉讓。技術轉讓的征稅優惠政策有待明確。

    3 月 5 日，李克強總理在“兩會”政府工作報告中公布了包括小微企業年應納稅所得額提高至 50 萬、研發費加計扣除由 50% 提高到 75%、增值稅稅率由現行的四檔簡并到三檔等減稅措施。 在兩票制、營改增等背景下，這些措施對于醫藥企業來說可謂重大利好。

    政府工作報告指出，今年赤字率擬按 3% 安排，赤字率保持不變，主要是為了進一步減稅降費，全年再減少企業稅負3500 億元左右、涉企收費約 2000 億元，一定要讓市場主體有切身感受。 與此同時，一些組合稅收減免政策同時公布： 小微企業享受減半征收所得稅優惠的范圍將繼續擴大，年應納稅所得額上限由 30 萬元提高到 50 萬元； 科技型中小企業研發費用加計扣除比例由 50% 提高到 75%，千方百計使結構性減稅力度和效應進一步顯現。

    由于此前一些名目繁多的收費使許多企業不堪重負，政府報告進一步提出要大幅降低非稅負擔： 一是全面清理規范政府性基金，取消城市公用事業附加等基金，授權地方政府自主減免部分基金。 二是取消或停征中央涉企行政事業性收費35 項，收費項目再減少一半以上，保留的項目要盡可能降低收費標準。各地也要削減涉企行政事業性收費。 三是減少政府定價的涉企經營性收費，清理取消行政審批中介服務違規收費，推動降低金融、鐵路貨運等領域涉企經營性收費，加強對市場調節類經營服務性收費的監管。 四是繼續適當降低“五險一金”有關繳費比例。 五是通過深化改革、完善政策，降低企業制度性交易成本，降低用能、物流等成本。各有關部門和單位都要舍小利顧大義，使企業輕裝上陣，創造條件形成我國競爭新優勢。

    落實和完善全面推開營改增試點政策。簡化增值稅稅率結構，今年由四檔稅率簡并至三檔，營造簡潔透明、更加公平的稅收環境，進一步減輕企業稅收負擔。推進中央與地方財政事權和支出責任劃分改革，加快制定收入劃分總體方案，健全地方稅體系，規范地方政府舉債行為。深入推進政府預決算公開，倒逼沉淀資金盤活，提高資金使用效率，每一筆錢都要花在明處、用出實效。
    此番總理報告中提出的科技型中小企業研發費用加計扣除比例由 50% 提高到 75%，千方百計使結構性減稅力度和效應進一步顯現，對研發型藥企來說，無疑將最先從稅收上感受到新政帶來的改變。